青岛烈冰科技空间转录组技术支持

单细胞测序是指针对单个细胞进行全转录组测序分析，可精确地描述每一个细胞的状态，在异质性发育过程中具有不可忽视的应用价值。然而，单细胞测序无法给出固态异质化组织中细胞空间排布信息，对于揭示发育过程、病理微环境都存在很大的局限性。空间转录组测序以点阵形式记录病理切片细胞的空间信息并进行测序，可以精确指示点阵内的全部基因表达情况。空间转录组测序的加入，无疑让单细胞测序如虎添翼，更精确地勾勒了组织水平的异质性。空间转录组可展示组织切片中不同区域的基因表达情况，揭示精细病理区域的信号通路。青岛烈冰科技空间转录组技术支持

空间转录组测序是在组织原位检测全转录组基因表达的⼀种技术，可以展⽰组织切⽚中不同区域的基因表达情况，同时能够得到⽬的基因在组织内部的空间位置信息。与传统的全基因转录组或单细胞转录组测序相⽐，空间转录组测序浆病理影像（H&E染⾊）与测序数据映射在⼀起，进⽽可以分析组织切内部空间结构的细胞异质性。常规单细胞转录组测序技术丢失了细胞在原组织中至关重要的空间位置信息，而单细胞空间转录组技术在进行单细胞转录组测序的同时保留并记录了细胞的空间位置信息。空间转录组技术能够揭示细胞间的相互作用以及细胞所处的微环境，将成为发育生物学、神经生物学、免疫生物学等领域的研究利器。武汉空间转录组数据分析可视化烈冰科技已建立了基于空间转录组的高通量测序实验多平台。

基于桥式PCR技术的簇生成可以将模版链迅速扩增成千上万倍，保证过程中足够的测序深度。测序时使用特殊标记的dNTP：1）碱基上通过敏感键修饰上不同的荧光基团，用于区分ATCG；2）3端使用叠氮基团封闭，保证一次循环只上一个dNTP。每一轮循环结束时，会通过高速荧光显微镜记录荧光图像，再通入试剂除去荧光基团和叠氮基团，开启下一循环。通过分析读取同一位点的荧光，实时获取模版链的碱基序列。由于过程中使用的化学反应并不可控，随着循环数的增大会出现不同步的情况，因此Illumina的读长只能限制在200bp左右。

烈冰生物真正实现空间转录组测序的全程把控，做到从实验设计、空间信息标记、建库测序、定制化分析的全流程一站式服务，助力高分文章发表；专业实验团队保证样本的高度一致性；专业的生物学团队提供个性化的产品应用场景解读、保持对生物学意义的关注；强大的生信分析团队一对一地进行详实科学的实验方案设计并提供多次售后分析；可接受样品类别为冰冻组织:新鲜样本经液氮预冷的异戊烷速冻，-80℃保存OCT包埋组织:新鲜组织异戊烷速冻后进行OCT包埋，或新鲜组织直接OCT包埋后-80℃速冻,注意标明样本方向，样本于-80℃保存样本处理和运输过程需要在低温环境助力探索生命时空多维度的动态变化的生物学信息；助力生命健康医疗大时代！

空间转录组测序的关键就在于，解决了空间位置保留的问题。被放置在芯片区域内的冰冻组织切片在经过H&E染色和成像记录后，会被进行透化处理，释放细胞中的RNA。芯片上的捕获引物的中段设置了带有独特标识的条形码区域。芯片被划分为了数个不同的捕获区域，每个捕获区域中锚定的引物都带有不同的条形码序列。每个区域对应的组织位置会被记录下来，然后再进行测序后，通过条形码将不同区域的测序结果，映射到对应的组织位置上，拼贴形成组织样品的空间转录组图像。烈冰引进国际主流空间转录组测序平台，提供保留组织内部精细区域的空间信息的转录组测序。深圳上海烈冰生物空间转录组测序服务

丰富的测序和数据分析经验，烈冰配套全程个性化、定制化地数据分析服务。青岛烈冰科技空间转录组技术支持

空间转录组测序与单细胞测序的结果不同，这里存在一个概念叫做NumberofSpotsundertissue，即，空间转录组片子上组织覆盖的有效的spot位点。这个有效Spot的筛选标准是有UMI以及有序列表达。那么这个时候，贴片的质量就成为了制约空间转录组有效区域的要点了。如果组织没有很好地覆盖到空转片上，那么容易出现虽然有HE染色有组织片子，但是没有基因表达，即无有效Spot位点。同样的，另一个就是组织切片的大小，也就是说组织切片在整个玻片的覆盖面积越小，分析的有效区域就越少。这两者基本上决定了整个空间转录组分析结果的基础质量。青岛烈冰科技空间转录组技术支持

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